Differbetween
- Co oznacza molekularne dokowanie?
- Co to jest dobry wynik za dokowanie?
- Jakie są rodzaje dokowania?
- Do czego służy dokowanie molekularne?
- Co oznacza dokowanie?
- Co to jest Rmsd w dokowaniu?
- Co to jest ślepe dokowanie?
- Co to jest powinowactwo wiązania w dokowaniu?
- Które narzędzie jest używane do dokowania opartego na strukturze?
- Dlaczego dokowanie zostało zakończone?
- Co to są witryny dokujące?
Co oznacza molekularne dokowanie?
Dokowanie molekularne to badanie, w jaki sposób dwie lub więcej struktur molekularnych (np. Lek i enzym lub białko) pasują do siebie [50]. W prostej definicji, dokowanie to technika modelowania molekularnego, która służy do przewidywania interakcji białka (enzymu) z małymi cząsteczkami (ligandami).
Co to jest dobry wynik za dokowanie?
Dla Glide SP lub HTVS, wyniki -10 lub niższe zwykle oznaczają dobre wiązanie. W przypadku niektórych celów (np. Z płytkimi miejscami aktywnymi lub głównie oddziaływaniami hydrofobowymi), wyniki -8 lub -9 mogą być bardzo dobre.
Jakie są rodzaje dokowania?
Istnieją różne rodzaje molekularnych procedur dokowania obejmujących albo ligand / cel elastyczny, albo sztywny w oparciu o cele symulacji dokowania [6,7], takie jak dokowanie elastycznego liganda (cel jako sztywna cząsteczka), dokowanie sztywnego ciała (zarówno cel, jak i ligand jako sztywne cząsteczki) i elastyczne dokowanie (oba ...
Do czego służy dokowanie molekularne?
Dokowanie molekularne jest jedną z najczęściej stosowanych metod w projektowaniu leków opartych na strukturze, ze względu na jego zdolność do przewidywania konformacji wiązania drobnocząsteczkowych ligandów z odpowiednim docelowym miejscem wiązania.
Co oznacza dokowanie?
czasownik. Kiedy jeden statek kosmiczny dokuje lub jest zadokowany w innym, oba statki łączą się w przestrzeni. Prom powinien mieć możliwość dokowania do innego statku kosmicznego na orbicie. [VERB + with] Zadokowali moduł robota obok orbitującej stacji kosmicznej. [
Co to jest Rmsd w dokowaniu?
W dokowaniu wartość RMSD jest używana do porównania zadokowanej konformacji z konformacją odniesienia lub z inną zadokowaną konformacją. ... w tym przypadku bierzesz współkrystalizowaną konformację małej cząsteczki i ponownie próbujesz odtworzyć tę samą konformację w danym miejscu wiązania.
Co to jest ślepe dokowanie?
Ślepe dokowanie odnosi się do dokowania liganda na całej powierzchni białka bez wcześniejszej wiedzy o docelowej kieszeni. Dokowanie na ślepo obejmuje kilka prób / przebiegów i kilka obliczeń energii, zanim zostanie znaleziona korzystna pozycja kompleksu białko-ligand.
Co to jest powinowactwo wiązania w dokowaniu?
[1], jest metodą obliczeniową, która praktycznie próbuje przewidzieć zespół (zwykle) dwóch partnerów wiążących. ... W opartym na strukturze dokowaniu małych cząsteczek mała cząsteczka ligandu jest umieszczana w jamie wiążącej białka docelowego, a wynikająca z tego pozycja dokowania jest oceniana za pomocą określonej funkcji punktacji.
Które narzędzie jest używane do dokowania opartego na strukturze?
Surflex i FlexX są szeroko stosowanymi programami dokowania molekularnego wykorzystującymi empiryczne funkcje punktacji [31,39]. Trzecim podejściem stosowanym do oceny energii wiązania ligand-receptor są oparte na wiedzy funkcje punktacji.
Dlaczego dokowanie zostało zakończone?
Cel, powód. W przeszłości uważano, że obcinanie ogonów zapobiega wściekliźnie, wzmacnia grzbiet, zwiększa prędkość zwierzęcia i zapobiega urazom podczas szczurów, walki i przynęty. Obcinanie ogonów odbywa się w dzisiejszych czasach w celach profilaktycznych, terapeutycznych, kosmetycznych i / lub w celu zapobiegania urazom.
Co to są witryny dokujące?
Stwierdzono, że specyficzność substratowa kinaz białkowych w wielu przypadkach jest określana przynajmniej częściowo przez krótkie regiony w substracie, znane jako miejsca dokowania. Miejsca dokowania są specyficzne i modułowe i mogą znacznie zwiększyć wydajność fosforylacji.
